嘉峪關市疾控中心致病菌識別網菌株測序第三次詢價采購公告
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公告摘要
各有關單位請于2023.11.18前與公告中聯系人聯系，及時參與投標等相關工作，以免錯失商業機會。
部分信息內容如下：（查看詳細信息請登錄）
采購標段信息
序號 標段名稱 標段編號 采購類別 最高限價 * ****疾控中心致病菌識別網菌株測序第三次詢價采購 JYGCDC-****-*** 服務類 *****.**(元)
公告內容
致病菌識別網菌株測序第三次詢價采購公告
****疾病預防控制中心現就致病菌識別網菌株測序進行第三次公開詢價采購，歡迎具有相關資格的企業或供貨商報名參加。
一、招標編號：JYGCDC-****-***
二.供應商資格要求：
*.企業法人營業執照（三證合一）副本掃描件；
*.法定代表人身份證（正、反面復印件）；
*.提供企業法人針對本次招標的授權函（原件）及被授權人身份證（正、反面復印件）；
*.供應商具有質量管理體系認證證書ISO ****:****（通過認證范圍：基因測序及生物信息學分析、DNA 合成、TA 克隆熒光定量 PCR、SNP 篩查的技術服務）；
*.上述資質復印件必須加蓋投標商公章。
三、招標報名及競價時間：
*.招標報名：****年**月**日**:**至****年**月**日**:**
*.資質審核：****年**月**日**:**至****年**月**日**:**
*.競價時間：****年**月**日**:**至****年**月**日**:**
四、聯系方式：
招標單位：**省****疾病預防控制中心
地址：**省***建設西路***號
聯 系 人：楊坤合
聯系電話：***********
五.相關事宜
*.本公告在**省陽光采購平臺上發布
*.本次定標在所有資質和參數符合的條件下低價確定供應商（包括郵寄等費用 ）；
*.報價單須有報價單位、聯系人及電話，并加蓋公章；
*.中標后請與我中心檢驗科聯系（鞏芳芳****-*******）；
*.接到中標通知*個工作日之內簽訂協議，**個工作日內完成服務；
*.交貨地點為****疾控中心
六、參數及數量
序號
物品名稱
規格/型號/參數
單位
數量
備注
*
**株致病菌測序ont平臺完成圖
*、原始測序數據的質控;*、高質量數據獲取;*、基因組序列拼裝與分析;*、蛋白編碼基因預測;*、質粒序列比對;*、非編碼 RNA 預測;*、其他非編碼RNA 預測;*、CRISPRs 預測;*、重復序列預測;**、原噬菌體預測;**、基因島預測;**、致病菌毒力因子（VFDB）分析;**、抗生素抗性（CARD）分析;**、碳水化合物活性酶（CAZy）分析;**、信號肽預測;**、跨膜螺旋預測;**、蛋白編碼基因的序列比對;**、蛋白編碼基因的 GO 注釋;**、蛋白編碼基因的eggNOG 注釋;**、蛋白編碼基因的 KEGG 注釋;**、蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋;**、Pfam注釋;**、TCDB 注釋;**、PHI 注釋;**、基因組圈圖繪制;**、MLST分析;
份
**
中標商測序數據按時交給****疾病預防控制中心，若中標商提供測序數據及分析不合格，中標商需免費再次測序，直到數據滿意可以正常使用為止。
*
**株致病菌測序框架圖
*、原始測序數據的質控;*、高質量數據獲取;*、基因組序列拼裝與分析;*、蛋白編碼基因預測 ;*、非編碼 RNA 預測 ;*、其他非編碼 RNA 預測 ;*、CRISPRs 預測 ;*、蛋白編碼基因的序列比對;*、蛋白編碼基因的 GO 注釋 ;**、蛋白編碼基因的 eggNOG 注釋 ;**、蛋白編碼基因的 KEGG 注釋 ;**、蛋白編碼基因的 Swiss-Prot 注釋;**、致病菌毒力因子分析;**、抗生素抗性（CARD）分析;**、fusA基因;
份
**
*
**份樣品中真菌菌群分析（ITS擴增子測序）
一、測序數據預處理
*.原始測序數據預處理 *.序列去噪或聚類 *.物種分類學注釋 *.構建系統發育樹*.ASV/OTU 表抽平
二、物種組成分析
*.分類單元數統計 *.分類學組成分析 *.分類等級樹圖 *.GraPhlAn進化樹圖 *.Krona 物種組成圖
三、Alpha 多樣性分析*.Alpha 多樣性指數 *.稀疏曲線 *.物種累積曲線 *. 豐度等級曲線
四、Beta 多樣性分析
*.距離矩陣與PCoA 分析 *.NMDS 分析 *.UPGMA 聚類分析 *.組間距離顯著性分析 *.Adonis 差異分析
五、物種差異分析與標志物種篩選
*.ASV/OTU 韋恩圖或花瓣圖*.物種組成熱圖 *.PCA 主成分分析*.MetagenomeSeq 分析 *.LEfSe 分析 *.OPLS-DA 分析 *.隨機森林分析
六、關聯網絡分析 *.關聯網絡分析與展示
七、菌群代謝功能預測 *.PICRUSt* 分析*.功能單元 PCoA 分析 *.代謝通路統計 *.代謝通路差異分析 *.差異通路的物種組成
份
**
****疾病預防控制中心
****年**月**日
提示：投標人從公告發布之日起即可登錄****政府采購限額以下項目陽光交易系統（http://***.**.***.**:****）進行投標競價
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