廣州體育學院購買人糞便6種短鏈脂肪酸GC-MS定量分析等競價公告

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委托方提供樣本，測試方主要進行：1.樣本預處理 2. GC-MS分析 3. 數據分析內容 4. 原始色譜圖的可視化檢查 5. 標準品含量測定 6. 樣品中含量測定

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(1) 提取RNA，基于Illumina HiSeq PE150測序技術,測序數據量每個樣品產生不低于6Gb clean data的95%，總測序量不低于144Gb clean data，平均Q30≥85%，完成后期數據生信分析主要如下：1測序質量值分布統計； (2) 測序堿基質量控制； (3) 測序數據產出統計； (4) 與參考序列進行比對，正鏈、負鏈比對數目統計； (5) 與相關生物數據庫（miRBASE，RepBASE，Rfam，SILVA，GtRNAdb等）及參考基因組（或轉錄組）比對，分類注釋Small RNA； (6) 已知miRNA鑒定與新miRNA預測； (7) miRNA長度分布分析； (8) small RNA基因組分布分析（針對有ref物種）及位置信息； (9) miRNA堿基偏好性分析； (10) miRNA堿基編輯分析； (11) miRNA家族分析； (12) miRNA定量分析； (13) 樣本間相關性比較； (14) miRNA差異表達分析：差異表達篩選；差異表達miRNA統計； (15) 差異表達miRNA聚類分析； (16) miRNA靶基因預測； (17) 差異表達miRNA靶基因注釋（NR、Swiss-prot、 Pfam、EggNOG、GO、KEGG）； 差異miRNA靶基因GO、KEGG富集分析。

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富集外泌體并提取外泌體RNA，基于Illumina 測序平臺測序；平均每個樣品產生10 M raw reads（單個樣品數據量往下浮動小于5%），保證Q30達到85%，完成后期數據生信分析主要如下：1測序質量值分布統計； (1) 測序堿基質量控制； (2) 測序數據產出統計； (3) 與參考序列進行比對，正鏈、負鏈比對數目統計； (4) 與相關生物數據庫（miRBASE，RepBASE，Rfam，SILVA，GtRNAdb等）及參考基因組（或轉錄組）比對，分類注釋Small RNA； (5) 已知miRNA鑒定與新miRNA預測； (6) miRNA長度分布分析； (7) small RNA基因組分布分析（針對有ref物種）及位置信息； (8) miRNA堿基偏好性分析； (9) miRNA堿基編輯分析； (10) miRNA家族分析； (11) miRNA定量分析； (12) 樣本間相關性比較； (13) miRNA差異表達分析：差異表達篩選；差異表達miRNA統計； (14) 差異表達miRNA聚類分析； (15) miRNA靶基因預測； (16) 差異表達miRNA靶基因注釋（NR、Swiss-prot、 Pfam、EggNOG、GO、KEGG）； 差異miRNA靶基因GO、KEGG富集分析。

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